Thần Vô Gia Cư (Phần 2) tiếp tục cuộc phiêu lưu của Yato, một vị thần nhỏ vô danh. Sau thời gian dài xa cách, Yato cuối cùng đã hàn gắn được mối quan hệ với Yukine, Regalia của mình.
Yato vẫn tiếp tục nhận những công việc lặt vặt với thù lao 5 yên mỗi người. Mục tiêu của anh là một ngày nào đó sẽ có hàng triệu người thờ phượng và xây dựng ngôi đền lớn của riêng mình. Bên cạnh đó, anh vẫn nỗ lực để sửa chữa tâm hồn lỏng lẻo của Hiyori Iki, người bạn thân thiết của mình.
Trong khi thực hiện các công việc và dự định, Yato cũng không quên chuẩn bị cho cuộc sống mới của Hiyori khi cô chuyển sang trung học. Những câu chuyện hài hước và thú vị tiếp tục được tạo ra từ cuộc sống hàng ngày của Yato và những người bạn xung quanh.
Cuộc hành trình của Yato và các nhân vật vẫn tiếp diễn với nhiều điều bất ngờ và thú vị.